Protein–RNA interactions for Protein: Q03265

Atp5a1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5a1Q03265 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp5a1Q03265 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms