Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ddr1Q03146 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms