Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mmp11Q02853 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mmp11Q02853 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms