Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nucb1Q02819 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nucb1Q02819 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms