Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gjb5Q02739 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms