Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxd1Q01822 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hoxd1Q01822 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms