Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mc1rQ01727 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mc1rQ01727 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.2 ms