Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Top2aQ01320 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Top2aQ01320 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Top2aQ01320 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms