Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga4Q00651 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itga4Q00651 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms