Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apba2P98084 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Apba2P98084 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Apba2P98084 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Apba2P98084 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Apba2P98084 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms