Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shc1P98083 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shc1P98083 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shc1P98083 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms