Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lama4P97927 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama4P97927 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lama4P97927 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lama4P97927 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lama4P97927 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms