Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Meis3P97368 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Meis3P97368 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms