Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NyxP83503 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NyxP83503 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NyxP83503 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NyxP83503 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NyxP83503 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NyxP83503 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NyxP83503 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NyxP83503 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NyxP83503 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NyxP83503 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NyxP83503 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NyxP83503 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NyxP83503 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms