Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad50P70388 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad50P70388 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad50P70388 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms