Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smad1P70340 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smad1P70340 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smad1P70340 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms