Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cux2P70298 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cux2P70298 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux2P70298 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cux2P70298 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms