Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfixP70257 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfixP70257 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfixP70257 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfixP70257 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfixP70257 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfixP70257 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfixP70257 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfixP70257 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfixP70257 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfixP70257 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfixP70257 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NfixP70257 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NfixP70257 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NfixP70257 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms