Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabrb3P63080 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabrb3P63080 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms