Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acta2P62737 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acta2P62737 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms