Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tbpl1P62340 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms