Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf1P61148 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fgf1P61148 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms