Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b6P59708 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b6P59708 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms