Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hps5P59438 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hps5P59438 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms