Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps33bP59016 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps33bP59016 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms