Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Setd4P58467 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Setd4P58467 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms