Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Bace1P56818 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bace1P56818 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms