Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Abcd3P55096 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Abcd3P55096 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms