Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acod1P54987 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acod1P54987 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms