Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cux1P53564 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cux1P53564 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cux1P53564 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux1P53564 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cux1P53564 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Cux1P53564 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms