Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upp1P52624 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upp1P52624 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms