Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apobec1P51908 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms