Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FmodP50608 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FmodP50608 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FmodP50608 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FmodP50608 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FmodP50608 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FmodP50608 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms