Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cxcl5P50228 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms