Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbp3P49194 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbp3P49194 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbp3P49194 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms