Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn1bP46414 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cdkn1bP46414 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms