Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgavP43406 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms