Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc19a1P41438 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc19a1P41438 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms