Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Rpl28P41105 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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