Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csf3rP40223 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Csf3rP40223 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms