Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Grin2aP35436 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Grin2aP35436 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2aP35436 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms