Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sstr1P30873 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms