Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PtprmP28828 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprmP28828 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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