Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RxraP28700 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RxraP28700 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RxraP28700 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RxraP28700 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RxraP28700 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms