Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb9P28076 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms