Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd247P24161 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd247P24161 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd247P24161 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms