Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pou3f1P21952 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pou3f1P21952 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms