Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P18532 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P18532 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P18532 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18532 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18532 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18532 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P18532 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P18532 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P18532 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P18532 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P18532 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18532 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P18532 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms