Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtpraP18052 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtpraP18052 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtpraP18052 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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