Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dnmt1P13864 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Dnmt1P13864 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnmt1P13864 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnmt1P13864 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnmt1P13864 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnmt1P13864 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Dnmt1P13864 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms